Грузоперевалка ОАО «Новороссийский морской торговый порт» за 12 месяцев 2006 года составила 74 млн 899 тыс тонн, уменьшившись на 0,4 процента по сравнению с соответствующим периодом 2005 года.
 
Наливных грузов обработано 57 млн 174 тыс тонн (+1.7%), сухогрузов - 16 млн 889 тыс тонн (-7.8%).
 
В структуре сухогрузов черных металлов перевалено 6 млн 481 тыс тонн (+12%), зерновых - 4 млн 084 тыс тонн (-2%), химических - 1 млн 423 тыс тонн (-30%), ЖРС - 1 млн 029 тыс тонн (-47%), сахара сырца - 1 млн 230 тыс тонн (-2%), цветных металлов - 760 тыс тонн (-6), чугуна - 374 тыс тонн (-49%), металлолома - 258 тыс тонн (-23%).